MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 111444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009633	CTA	2	6	21233	21238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150387869
502	NC_009633	ACA	2	6	21330	21335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150387869
503	NC_009633	TGG	3	9	21341	21349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150387869
504	NC_009633	TGAT	2	8	21412	21419	25 %	50 %	25 %	0 %	150387869
505	NC_009633	A	6	6	21420	21425	100 %	0 %	0 %	0 %	150387869
506	NC_009633	CTACG	2	10	21441	21450	20 %	20 %	20 %	40 %	150387869
507	NC_009633	TAA	2	6	21505	21510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387869
508	NC_009633	ATT	2	6	21586	21591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387869
509	NC_009633	GTTT	2	8	21650	21657	0 %	75 %	25 %	0 %	150387869
510	NC_009633	TGAT	2	8	21718	21725	25 %	50 %	25 %	0 %	150387869
511	NC_009633	CACC	2	8	21735	21742	25 %	0 %	0 %	75 %	150387869
512	NC_009633	AGG	2	6	21769	21774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150387869
513	NC_009633	AGC	2	6	21857	21862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150387869
514	NC_009633	TCA	2	6	21893	21898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150387869
515	NC_009633	AAG	2	6	21908	21913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150387869
516	NC_009633	GAT	2	6	21918	21923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387869
517	NC_009633	AGC	2	6	21929	21934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150387869
518	NC_009633	AT	3	6	22023	22028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_009633	ATG	2	6	22032	22037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_009633	TAA	2	6	22055	22060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_009633	TAG	2	6	22071	22076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_009633	GTC	2	6	22082	22087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_009633	A	7	7	22144	22150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_009633	TCA	2	6	22164	22169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_009633	AT	3	6	22176	22181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_009633	CAAG	2	8	22214	22221	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
527	NC_009633	TA	4	8	22376	22383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_009633	GGC	2	6	22414	22419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_009633	GAA	2	6	22472	22477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_009633	GCG	2	6	22488	22493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_009633	ACCT	2	8	22517	22524	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_009633	ACA	2	6	22536	22541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_009633	CGA	2	6	22665	22670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_009633	GCA	2	6	22739	22744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_009633	GCA	2	6	22779	22784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_009633	CGC	2	6	22786	22791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_009633	GAA	2	6	22835	22840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_009633	AGG	2	6	22856	22861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_009633	CAG	2	6	22883	22888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_009633	GTA	2	6	22989	22994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009633	AGG	2	6	23072	23077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009633	AGC	2	6	23298	23303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_009633	GAA	2	6	23333	23338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_009633	GGT	2	6	23409	23414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_009633	GTC	2	6	23423	23428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_009633	TCGTG	2	10	23432	23441	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
547	NC_009633	CAG	2	6	23491	23496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_009633	AG	3	6	23513	23518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_009633	GGA	2	6	23536	23541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_009633	ATC	2	6	23560	23565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_009633	AC	3	6	23587	23592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_009633	AC	3	6	23756	23761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_009633	CAC	2	6	23771	23776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_009633	AGG	2	6	23815	23820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_009633	CCT	2	6	23897	23902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_009633	GA	3	6	23941	23946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_009633	TC	3	6	23952	23957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
558	NC_009633	TAA	2	6	23958	23963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_009633	ATC	2	6	24084	24089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_009633	GCTA	2	8	24095	24102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
561	NC_009633	GACT	2	8	24106	24113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
562	NC_009633	TAAA	2	8	24141	24148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_009633	TTA	2	6	24273	24278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_009633	AGA	2	6	24440	24445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_009633	AGAA	2	8	24486	24493	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
566	NC_009633	GCG	2	6	24512	24517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_009633	AAG	3	9	24581	24589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_009633	GTA	2	6	24595	24600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_009633	AAG	2	6	24653	24658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_009633	G	6	6	24713	24718	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
571	NC_009633	ACC	2	6	24719	24724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_009633	C	6	6	24723	24728	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
573	NC_009633	TAC	2	6	24738	24743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_009633	TG	3	6	24854	24859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_009633	TATGG	2	10	24893	24902	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
576	NC_009633	GAT	2	6	25069	25074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_009633	CGT	2	6	25230	25235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_009633	AGC	2	6	25377	25382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_009633	AGA	2	6	25541	25546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_009633	GA	3	6	25545	25550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_009633	ACA	2	6	25678	25683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_009633	G	6	6	25723	25728	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
583	NC_009633	GTTG	2	8	25755	25762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_009633	TG	3	6	25761	25766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_009633	GGTG	2	8	25923	25930	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
586	NC_009633	GA	3	6	25933	25938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_009633	CGG	2	6	26203	26208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_009633	CAA	2	6	26297	26302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_009633	TGG	2	6	26453	26458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_009633	GTA	2	6	26483	26488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_009633	GGT	2	6	26698	26703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_009633	TCA	2	6	26813	26818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_009633	GTA	2	6	26831	26836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_009633	CGT	2	6	26893	26898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_009633	GAG	2	6	26942	26947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_009633	GTT	2	6	26996	27001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_009633	C	6	6	27069	27074	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
598	NC_009633	AAGAT	2	10	27077	27086	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
599	NC_009633	AG	3	6	27100	27105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_009633	GA	3	6	27231	27236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_009633	TAA	2	6	27255	27260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_009633	GTT	2	6	27262	27267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_009633	AATC	2	8	27310	27317	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
604	NC_009633	CTAA	2	8	27323	27330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
605	NC_009633	GTC	2	6	27565	27570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_009633	TAG	2	6	27596	27601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_009633	T	7	7	27605	27611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_009633	T	6	6	27614	27619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_009633	ACT	2	6	27624	27629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_009633	ATC	2	6	27658	27663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_009633	T	7	7	27676	27682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_009633	AATGA	2	10	27693	27702	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
613	NC_009633	GATTA	2	10	27721	27730	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
614	NC_009633	A	6	6	27730	27735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_009633	ATT	2	6	27759	27764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_009633	ATGAT	2	10	27770	27779	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
617	NC_009633	AT	3	6	27778	27783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_009633	ACA	2	6	27821	27826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_009633	ATC	2	6	27838	27843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_009633	A	7	7	27882	27888	100 %	0 %	0 %	0 %	150387870
621	NC_009633	CAA	2	6	27986	27991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150387870
622	NC_009633	TTG	2	6	28007	28012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387870
623	NC_009633	TAA	2	6	28062	28067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150387870
624	NC_009633	ATG	2	6	28088	28093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387870
625	NC_009633	TGAT	2	8	28115	28122	25 %	50 %	25 %	0 %	150387870
626	NC_009633	TTC	2	6	28185	28190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150387870
627	NC_009633	TGT	2	6	28219	28224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150387870
628	NC_009633	CTT	2	6	28226	28231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150387870
629	NC_009633	AGT	2	6	28245	28250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387870
630	NC_009633	AGC	2	6	28299	28304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150387870
631	NC_009633	GAAA	2	8	28329	28336	75 %	0 %	25 %	0 %	150387870
632	NC_009633	CAT	2	6	28366	28371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150387870
633	NC_009633	GTA	2	6	28456	28461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150387870
634	NC_009633	A	6	6	28461	28466	100 %	0 %	0 %	0 %	150387870
635	NC_009633	ATT	2	6	28495	28500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150387870
636	NC_009633	A	7	7	28569	28575	100 %	0 %	0 %	0 %	150387870
637	NC_009633	CTA	2	6	28583	28588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150387870
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